Der selbstgesetzte Auftrag der Fachgruppe Verwaltung ist der regelmäßige Erfahrungsaustausch der Museumseinrichtungen in Berlin zu administrativen Themen. Die Fachgruppe Verwaltung hat sich in der Vergangenheit den Fragen der Ausgaben- und Einnahmenplanung sowie der neuen Vertragsgestaltung der Langen Nacht der Museen angenommen. Weitere Themen sind die Eintrittsentgelte der Museen bzw. Ermäßigungs- und Befreiungsbestände sowie Angebote für Geflüchtete.